Centralne Projekty Badawcze
- Uchodźstwo, emigracja niepodległościowa 1939–1990 – dr Rafał Sierchuła
- Ruch komunistyczny i aparat władzy 1917–1990 – dr Marcin Jurek
- „Solidarność” i opór społeczny 1956–1989 – prof. dr hab. Krzysztof Brzechczyn, dr Przemysław Zwiernik
- II wojna światowa i okupacja ziem polskich 1939–1944/45 – dr Izabella Kopczyńska
- Władze komunistyczne wobec kościołów i związków wyznaniowych w Polsce 1944–1989 – prof. UAM dr hab. Konrad Białecki, dr hab. Elżbieta Wojcieszyk
Oddziałowe projekty badawcze:
- Wielkopolska w XX-leciu międzywojennym – dr Izabella Kopczyńska
- Wielkopolska w okresie okupacji – dr Rafał Sierchuła, dr Izabella Kopczyńska
- Wielkopolska w latach 1945–1989 – prof. UAM dr hab. Konrad Białecki, dr hab. Elżbieta Wojcieszyk, dr Marcin Jurek, dr Przemysław Zwiernik
- Metodologiczne i teoretyczne problemy badania najnowszej historii Polski – prof. dr hab. Krzysztof Brzechczyn