Wybory do Prezydium Kolegium odbyły się w związku z upływem rocznej kadencji przewodniczącej Kolegium-pani Marii Myślińskiej. Prof. Andrzej Paczkowski, który pokieruje pracami Kolegium IPN w czwartym roku jego działalności, jest Kierownikiem Zakładu Historii Politycznej w Instytucie Studiów Politycznych PAN.
Dotychczas przewodniczącymi Kolegium IPN byli: dr Andrzej Grajewski (1999-2000), dr Sławomir Radoń (2000-2001) oraz Maria Myślińska (2001-2002).