Publikacje Wydawnictwa IPN są dostrzegane i doceniane nie tylko przez czytelników, ale również przez ekspertów, dowodem na to są laury w konkursach branżowych. Rok 2025 obfitował w głośne, nierzadko zaskakujące rozstrzygnięcia plebiscytów książkowych. Wiele książek wydanych nakładem Wydawnictwa IPN zostało nagrodzonych, wyróżnionych bądź otrzymało nominacje. Łącznie w 2025 r. publikacje IPN zdobyły 12 nagród głównych.
Nagroda Przeglądu Wschodniego
- nagroda w kategorii „Dzieje Polaków na Wschodzie” – Piotr Olechowski, Agonia Polaków we Lwowie 1944-1959. Seria: Monografie
Nagroda „Gwiazda Szafirowej”
Nagroda Prezydenta Olsztyna im. Bohdana Koziełło-Poklewskiego
- nagroda w dziedzinie historii – Krzysztof Andrzej Kierski, Relacje rządców diecezji warmińskiej z władzami komunistycznymi Polski w latach 1945-1989
Nagroda Stowarzyszenia Wydawców Katolickich FENIKS
- nagroda w kategorii „Niezłomny ks. Jerzy Popiełuszko – błogosławiony na nasze czasy” – Franciszek Dąbrowski, Aparat represji wobec ks. Jerzego Popiełuszki, T.4: Sprawa ks. Jerzego Popiełuszki w dokumentach Ministerstwa Bezpieczeństwa Państwowego Niemieckiej Republiki Demokratycznej
- nagroda w kategorii „seria wydawnicza / dzieła zebrane”, za serię „Wincenty Witos. Dzieła wybrane. Tom 1–5”
Sygnety Wydawnictwa IPN
- nagroda w kategorii „Monografia” – Grzegorz Wołk, „Szaleńcy niepodległości”. Historia Konfederacji Polski Niepodległej
- nagroda w kategorii „Wydawnictwa źródłowe” – Radosław Żydonik, Kryptonim „Klan”. Służba Bezpieczeństwa wobec NSZZ „Solidarność” w Gdańsku”. Tom 3: październik 1981 – listopad 1983 r. Seria „Dokumenty”, t. 76
- nagroda w kategorii „Biografie” – Bartosz Bajków, Diana Maksimiuk, Florian Czarnyszewicz. Los człowieka, t. 1: Znad Berezyny nad La Platę (1900–1955)
- nagroda w kategorii „Wydawnictwa albumowe” – Jakub Gołębiewski, Katarzyna Dziedzic-Boboli, Ksiądz Jerzy Popiełuszko. Historia życia
- nagroda w kategorii „Publikacje popularnonaukowe” – Grzegorz Majchrzak, Stan wojenny. Historia znana, mniej znana i nieznana
- nagroda w głosowaniu internautów – Grzegorz Szczecina, Historyczno-patriotyczne rodowody misji ks. Jerzego Popiełuszki
Nagroda Literacka Miasta Radomia 2025
- nagroda w kategorii „Książka naukowa/popularnonaukowa” – Tomasz Krok, Afera teozofów. Siatka wywiadowcza mjr. Andrzeja Czaykowskiego (1949–1951)