Przeciwko Romanowi K. skierowano także inny akt oskarżenia - W dniu 1 grudnia 2005 roku prokurator Oddziałowej Komisji ŚZpNP w Rzeszowie skierował do Sądu Rejonowego w Nisku akt oskarżenia przeciwko Romanowi K. oskarżonemu o to, że w okresie od 14 marca 1949 roku do 4 sierpnia 1949 roku w Nisku, będąc funkcjonariuszem Powiatowego Urzędu Bezpieczeństwa Publicznego w Nisku, znęcał się fizycznie i psychicznie nad żołnierzem AK Wojciechem K. w ten sposób, że wielokrotnie bił go, zadając mu ciosy w różne części ciała, także przy użyciu drewnianego kołka, wielokrotnie raził go prądem elektrycznym, wcześniej podłączając go do induktora, zmuszał do długotrwałego wykonywania przysiadów, aż do całkowitej utraty sił i omdlenia, do siadania na krześle, na którym wcześniej rozsypano pinezki, umieszczał go również w nieoświetlonej, nie ogrzewanej, zawilgoconej, pozbawionej jakiegokolwiek wyposażenia celi, zwanej ciemnicą, a nadto, po wcześniejszym rozebraniu do naga, wystawiał na działanie mrozu, tj. o przestępstwo z art.286 § 1 i 246 w zw. z art.36 kk z1932 roku i art.2 ust.1 oraz art.3 ustawy z dnia 18 grudnia 1998 roku o IPN – KŚZpNP.
W trakcie rozprawy głównej w dniu 7 kwietnia 2006 r. Sąd Rejonowy dla Warszawy Pragi – Południe postanowił połączyć obie sprawy do wspólnego prowadzenia.