Większość dokumentów przechowywanych w Archiwum IPN wytworzono na maszynowym, dwudziestowiecznym papierze, który jest materiałem nietrwałym i ulega procesom degradacji.
Dlatego też od wielu lat przeprowadzane są zabiegi konserwatorskie mające na celu poprawę kondycji podłoża papierowego dokumentów, których stan zachowania utrudnia lub uniemożliwia udostępnienie i wykonanie kopii cyfrowych.
Zakres podejmowanych prac konserwatorskich, dobór środków i metod uzależniony jest od stanu zachowania archiwaliów, ich wrażliwości na środowisko wodne oraz wartości historycznej. Średnio co roku zabiegi te przeprowadzane są w Archiwum na prawie 16 tys. kart. Dokumenty ze śladami skażenia mikrobiologicznego poddawane są dodatkowo dezynfekcji w komorze fumigacyjnej.
Rozwijająca się współpraca archiwalna z instytucjami polonijnymi oraz uruchomienie projektu Archiwum Pełne Pamięci zaowocowały znacznym wzrostem liczby nabytków wymagających uporządkowania.